不一样。专科毕业证编号也就是电子注册号,毕业证编号不一样,因为学历和学位是不同的,证书编号自然也不会相同。毕业证是学生通过系统的学习,修完学校所安排的全部课程并成绩合格,达到毕业条件,由办学单位颁发的用于证明学习经历的书面凭证。